Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syne4Q8CII8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms