Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog3Q8CI04 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms