Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Rab11fip3Q8CHD8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip3Q8CHD8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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