Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

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Length 1,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rp1l1Q8CGM2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rp1l1Q8CGM2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rp1l1Q8CGM2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Rp1l1Q8CGM2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rp1l1Q8CGM2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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