Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab43Q8CG50 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rab43Q8CG50 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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