Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snx8Q8CFD4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx8Q8CFD4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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