Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh13Q8CEE7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh13Q8CEE7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms