Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms