Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SynpoQ8CC35 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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