Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntrobQ8CB62 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntrobQ8CB62 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntrobQ8CB62 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CntrobQ8CB62 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CntrobQ8CB62 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms