Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms