Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Parp9Q8CAS9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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