Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dclre1bQ8C7W7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms