Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms