Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3Y4

Kntc1, Kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kntc1Q8C3Y4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kntc1Q8C3Y4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Kntc1Q8C3Y4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kntc1Q8C3Y4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms