Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgif2Q8C0Y1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgif2Q8C0Y1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms