Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccser1Q8C0C4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms