Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms