Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pdcl3Q8BVF2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms