Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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