Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad3Q8BUN5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.7 ms