Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rccd1Q8BTU7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms