Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms