Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms