Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo38Q8BMI0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo38Q8BMI0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo38Q8BMI0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbxo38Q8BMI0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms