Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grik4Q8BMF5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Grik4Q8BMF5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms