Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms