Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp1Q8BJQ2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp1Q8BJQ2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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