Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms