Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q8BGC1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BGC1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms