Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc50Q810U5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms