Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfascQ810U3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms