Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrc27Q80YS5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms