Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lrfn4Q80XU8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrfn4Q80XU8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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