Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg2bQ80XK6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg2bQ80XK6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms