Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrde2Q80XC6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms