Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Avl9Q80U56 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Avl9Q80U56 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Avl9Q80U56 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Avl9Q80U56 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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