Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja2Q80U04 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 530.2 ms