Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms