Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trappc6aQ78XR0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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