Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ubfd1Q78JW9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ubfd1Q78JW9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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