Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cnih3Q6ZWS4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms