Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf3Q6ZQA6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Igsf3Q6ZQA6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms