Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cxcl3Q6W5C0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cxcl3Q6W5C0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cxcl3Q6W5C0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cxcl3Q6W5C0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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