Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmeff1Q6PFE7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmeff1Q6PFE7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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