Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms