Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt3Q6PE13 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrt3Q6PE13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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