Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc85bQ6PDY0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms