Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Zbtb40Q6PCS8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Zbtb40Q6PCS8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Zbtb40Q6PCS8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Zbtb40Q6PCS8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Zbtb40Q6PCS8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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