Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttbk1Q6PCN3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms